今日之森

还有多远,一念之间。

生物信息学从零开始学 7 Tsinghua源

2021-09-06


森言森语

红豆生南国,
春来发几枝。
愿君多采撷,
此物最相思。
——《相思》唐·王维

本来十一点就要回去休息了,结果安装个小软件居然等了半个小时,等着等着还终止了。

官方软件源还是不行,本来就是想试试官网源到底行不行。

事实证明不行。

于是删除之前加载的官网软件源,重新换回tsinghua源。


conda config --remove-key channels 
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/         conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/       
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/      
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 

于是,三两分钟就安装了五六个软件,tsinghua源可以。

 #!/bin/bash 
 conda install -y mafft 
 conda install -y blast 
 conda install -y fasttree 
 ...

另外关于zsh:command not find:conda 的解决办法

vi ~/.zshrc 
#末尾加入环境变量即可 
export ZSH=$HOME/.oh-my-zsh 
source ~/.zshrc