今日之森

还有多远,一念之间。

中国春 小麦基因组信息汇总

2021-09-06


无意间发现了IWGSC CSS版本的小麦基因组文件,遂更新下。

IWGSC CSS版本:Traes_1AS_E6058767A.1

下载地址:http://genedenovoweb.ticp.net:81/Wheat_GDR1246/index.php?m=download&f=index

TGAC版本:TRIAE_CS42_U_TGACv1_641506_AA2096870.1

该版本数据所在网站似乎已经不再服务。

RefSeq v1.0版本:TraesCS1A01G000100.1

下载地址:https://wheat-urgi.versailles.inra.fr/Seq-Repository/Annotations

RefSeq v1.1版本:TraesCS1A02G000100.1

下载地址:https://wheat-urgi.versailles.inra.fr/Seq-Repository/Annotations

RefSeq v2.0版本:(2.0基因组已经公布,注释基因声称2020年1月发布,但至今好像还没有看到2.0版本的注释信息,这次最新的版本为v2.1,这应该是也是为了有别于2.0而重新定义的版本号)

下载地址:https://wheat-urgi.versailles.inra.fr/Seq-Repository/Assemblies/v2.0/

RefSeq v1.2版本:(这是一个过渡版本,对RefSeq v1.1版本的局部进行了完善。)

下载地址:https://urgi.versailles.inrae.fr/download/iwgsc/IWGSC_RefSeq_Annotations/v1.2/

RefSeq v2.1版本:TraesCS1A03G0000200.1(目前最新的“中国春”参考基因组)

下载地址:https://urgi.versailles.inra.fr/download/iwgsc/IWGSC_RefSeq_Annotations/v2.1/