今日之森

还有多远,一念之间。

基因总是无法正确构建到载体上 你需要考虑吧这些

2021-09-06


森言森语 最初接触基因克隆和构建载体时,总会遇到这样那样的问题,构建载体作为很多实验的必须步骤,不应该成为阻挡后续实验的障碍。 这是因为通常来说,载体构建相关的问题都过于简单,吃晚饭前花十几二十分钟就关于“正确构建载体需要格外思考的几点问题”简单写一下。 构建载体常出现的问题 1、无法成功克隆到基因 2、基因无法成功连接至载体 3、检测质粒时发现目的基因大小不对 4、检测质粒时发现大小差不多,但测序结果不对 一般,在构建载体时,能遇到的也就这几个问题,如果有其他问题存在也大概与上述四个问题是密切相关的。 需要说的是,如果载体构建出了状况,就不要一味的重复了,一遍不成功,十遍也绝不会对。如果出现例外,那绝对是小概率事件。 那出现上述问题后从哪几方面思考呢? 1、确保克隆到的基因完全正确: 如果这一步出问题,无非两点原因:引物设计不合理,模板质量不高。 解决方法:多找几个模板同时进行克隆;重新评估引物的合理性和特异性,比如将引物长度增至40 bp左右。 2、关于酶切 酶切其实要求并不十分严格,正常操作下,不论电泳检测是否十分清楚,酶切产物足够连接用量了,没必要纠结。 3、关于酶切位点的选择 这一点很重要。通常很多同学在选择酶切位点时,会习惯性的选择师兄师姐们常用的酶切位点,比如BamHI等,但实际上这样是不行的。 此时需要注意:目的基因中不能出现所选酶切位点,否则,在连接时,残留的酶会对目的基因进行切割,这将直接导致实验的失败。 解决办法:选择酶切位点前,需要检查所选酶切位点是否存在于目的基因中。 小结 总之,如果构建载体时出现问题,就从这几方面一一排除: 引物设计是否合理? 酶切位点是否选择正确? 模板质量是否较好? PCR程序是否设置正确? 如果以上几点都没问题,那载体构建就不会出问题。 最后,其实不管构建载体还是其他实验,有时做不出来,排除最本质的原因之外,如果正常操作下出现状况, 一定是哪一步做错了或者疏忽了,应该尽量避免一味的机械重复。 还有哪些原因呢?欢迎大家在评论区留言。